Para entrar en el último capítulo debes ir al Dojo y buscar en el santuario a Otori. Allí, al hablar con él, podrás aceptar la última misión. Antes de hacerlo puedes ir al bar para entrenarte con las armas por última vez.

Una vez que comiences el capítulo, verás como Otori sigue un camino mientras tú debes buscar otro por el bosque. Avanza por el único camino posible hasta que veas una caseta a lo lejos y alrededor varios enemigos.

Elimínalos desde lejos y después acércate lentamente ya que saldrán más enemigos. Cuando los derrotes podrás coger en la caseta un chaleco antibalas. Sigue por el camino que hay detrás de la caseta y encontrarás un enemigo con katana.

Se cubre y esquiva tus ataques fácilmente, así que para vencerle debes esquivarle continuamente e intentar golpearle cada vez que falle su golpe. En el momento en que le aciertes una vez, sigue golpeando hasta completar una kata. Después de varios intentos le derrotarás, entonces sigue el camino y llegarás a un río. Continúa avanzando por él pero ten cuidado con los enemigos que aparecen. Al final del recorrido verás un pequeño hueco en donde debes entrar agachado.

Continúa por el único camino posible hasta llegar a la parte trasera de la mansión. Verás en un balcón a Otori. Por abajo aparecen varios enemigos disparándote, elimínalos para poder subir por las escaleras por donde ellos bajan.
Una vez que subas las escaleras gira a la derecha.

Acaba con los enemigos que hay y avanza hacia allí. A lo lejos, verás otro grupo de enemigos. Ten cuidado porque hay francotiradores que pueden dañarte a gran distancia.

Ve eliminándolos poco a poco sin avanzar mucho. Cuando veas que no quedan enemigos avanza y verás 3 vigas juntas, sube encima de ellas.

Por ahí podrás pasar como si fuera un puente. Ten mucho cuidado de no caerte, intenta caminar recto para no colarte entre las vigas. En el otro lado verás, de nuevo, más enemigos pero sólo un camino para avanzar.

Al final del recorrido encontrarás a Miyu apresada por Tokai (antes habrás visto a Otori acabar con varios enemigos)

Ahora debes enfrentarte a Tokai.

Es rápido, se cubre continuamente y esquiva tus golpes con facilidad. Usa la técnica empleada con el último ninja en el bosque. Esquivarle continuamente y según lo haces golpear. La mayoría de las veces te esquivará pero tampoco te dañará.

Cuando le aciertes en alguna ocasión, aprovecha para seguir haciendo la kata completa. Si gracias a estas catas ves que puedes romper su espada antes que quitarle toda su energía intenta hacer el pequeño escorpión, aunque casi siempre lo esquive alguna vez si le acertarás con él.

Una vez derrotado, Tokai caerá al suelo herido, entonces llegará Otori con intención de eliminarle. Tokai te avisará que Otori está envenenado.

Si dejas que Otori acabe con Tokai verás un final alternativo del juego (el final corto y malo). Además no tendrás oportunidad de repetir el capítulo, sólo podrás empezar una nueva partida desde el principio.

En cambio si paras a Otori (es fácil quitarle la espada con tus habilidades especiales) verás el final completo.

Este es el final del juego.