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- Control Pad: Mueve al personaje. |
| - Botón A: Salto. | |
| - Botón B: Disparo. | |
| - Botón L: Apuntar en diagonal. | |
| - Botón R: Combinado con el botón B, lanza Misiles o Bombas si estás como Morfosfera. | |
| - Botón Select: No se usa. | |
| - Botón Start: Pausa. Si estando en pausa pulsas el R te saldrá el Status del personaje. Con el botón L activarás el Modo Salvapantallas. |
MOVIMIENTOS ESPECIALES
Localización: Coordenada (X-10) de la Cubierta Principal.
Función: Te haces una bola, lo que te permite entrar por huecos inaccesibles de otra forma. Además puedes poner pequeñas Bombas usando el botón B.
Forma de Realizarlo: Pulsando dos veces el mando hacia abajo.

Localización: Coordenada (S-17) del Sector 2.
Función: Te permite saltar más alto que con el salto normal.

Localización: Coordenada (S-17) del Sector 2.
Función: Te permite saltar mientras estás transformado en Morfosfera.
Forma de Realizarlo: Pulsa el botón A mientras estás como Morfosfera.

Localización: Coordenada (M-4) del Sector 4.
Función: Te permite correr mucho y romper bloques que sólo se rompen de esta forma.
Forma de Realizarlo: Simplemente tienes que ir a una zona con explanada y pulsar el mando hacia uno de los lados durante un rato hasta que veas que a Samus le sale una estela.

Localización: Coordenada (U-24) de la Cubierta Principal.
Función: Te permite subir saltando varias veces, sin necesidad de apoyarte en ningún sitio.
Forma de Realizarlo: Tienes que pulsar el botón de salto y cuando Samus esté en el punto más alto, pulsa de nuevo el salto. Lo puedes realizar tantas veces como quieras.

Localización: Coordenada (G-13) Sector 1.
Función: Te permite subir saltando varias veces, además sirve para atacar a los enemigos y para romper ciertos bloques.
Forma de Realizarlo: Tienes que pulsar el botón de salto y cuando Samus esté en el punto más alto, pulsa de nuevo el salto. Lo puedes realizar tantas veces como quieras.

EBOTE EN PARED
Localización: Desde el principio.
Función: Te permite subir saltando varias veces, apoyándote en la pared.
Forma de Realizarlo: Tienes que pulsar el botón de salto hacia una pared. Cuando Samus toque la pared, tienes que pulsar el mando en dirección contraria y de nuevo el botón de salto.

ALTO CON ACELERACIÓN VERTICAL
Localización: Una vez que has conseguido la Aceleración. Coordenada (M-4) Sector 4.
Función: Te permite llegar a zonas muy elevadas y romper determinados bloques.
Forma de Realizarlo: Tienes que usar la Aceleración. Cuando veas que Samus parpadea, pulsa el mando hacia abajo para conservar la energía. En ese momento quédate quieto y pulsa el botón de salto (A).

ALTO CON ACELERACIÓN HORIZONTAL
Localización: Una vez que has conseguido la Aceleración Coordenada (M-4) Sector 4.
Función: Te permite llegar a zonas laterales alejadas y romper determinados bloques.
Forma de Realizarlo: Tienes que usar la Aceleración. Cuando veas que Samus parpadea, pulsa el mando hacia abajo para conservar la energía. En ese momento quédate quieto y pulsa el botón de salto (A) y posteriormente el mando hacia uno de los lados (cuando lo pulses mantenlo presionado).

ALTO CON ACELERACIÓN DIAGONAL
Localización: Una vez que has conseguido la Aceleración. Coordenada (M-4) Sector 4.
Función: Te permite llegar a zonas alejadas y romper determinados bloques.
Forma de Realizarlo: Tienes que usar la Aceleración. Cuando veas que Samus parpadea, pulsa el mando hacia abajo para conservar la energía. En ese momento quédate quieto y pulsa el botón de salto (A) y posteriormente el mando hacia una de las dos diagonales superiores (cuando la pulses mantenla presionada).
