Cuando salgas de la zona del Templo del Tiempo, volverás a la zona principal del desierto de Lanayru, aunque por una zona diferente de la anterior. Allí encontrarás bastantes arenas movedizas, por lo que deberás correr para alcanzar plataformas de suelo firme y no hundirte.
Llegado un momento, Fay te informará de que bajo algunos puntos de las arenas movedizas pasarán unas antiguas calzadas que, aunque no pueden verse por estar cubiertas por la arena, impedirán que te hundas.

Luego pondrá a tu disposición cuatro balizas más (recuerda que se plantan en los mapas con el botón
), las cuales deberás usar para marcar las calzadas que en el mapa sí pueden verse. De esa manera, podrás guiarte gracias a las columnas de luz que surgen de las balizas y avanzar con seguridad por encima de la arena. Gracias a eso, podrás seguir una calzada hacia el sudeste y acabar subiendo a lo alto de un muro que hay al final.


Una vez sobre el muro llegarás al lugar que te marcaron anteriormente con una cruz roja en el mapa, y allí verás una extraña máquina que tiene al lado los restos de un pequeño robot minero (y al norte la estatua de pelícaro "Zona norte del desierto"). Si destruyes las rocas que tiene enfrente con una flor bomba de tu saco de bombas, descubrirás una roca azul, y si la golpeas, activarás la extraña máquina, al pequeño robot minero y también a dos enemigos armados con espadas electrificadas.


Después de terminar con los enemigos tendrás que hablar con el pequeño robot para descubrir que la máquina no es otra cosa que la fuente de alimentación que abre la entrada a la refinería de Lanayru. También te enterarás de que son necesarias tres claves de seguridad para abrir el mecanismo, aunque afortunadamente Fay te actualizará la función de rastreo para que puedas rastrear la pista de los generadores que te dan las claves.


| Generador de la gota verde |
Desde la gran fuente de alimentación, dirígete hacia el sudoeste sin bajar del muro, y cuando llegues al final podrás ver que en la pared del fondo hay dos monolitos con cuencos. Utiliza el telescarabajo con gancho para coger la flor bomba que crece en un cactus y así podrás derribar el monolito de la izquierda y encontrar uno de los generadores.


Después utiliza dos balizas para marcar el camino que te lleve ahí sin hundirte en las arenas.


Una vez donde el generador, utiliza una flor bomba de tu saco de bombas para derribar una pared con una grieta que hay a la izquierda y así encontrarás una roca azul. Golpéala para activar el generador y entonces podrás ponerlo en marcha clavándole la espada con una estocada, pulsando
hacia la izquierda para girarlo y presionando
hacia dentro para encajarlo.


| Generador del rayo amarillo |
Dirígete a la estatua de pelícaro "Zona norte del desierto" y mira hacia el norte para ver que en la pared del fondo hay una grieta, y luego usa dos balizas para marcar el camino que te lleve ahí sin hundirte en las arenas.


Vuela la pared con una flor bomba de tu saco de bombas y así podrás entrar en un edificio enterrado por la arena.

Una vez dentro del edificio encontrarás bastantes arenas movedizas, varias plataformas con rocas y dos cangrancolas. Ve a la plataforma que hay en el centro de la estancia, enfrente de una puerta cerrada que hay al fondo (apoyándote en las conchas de los cangrancolas que primero deberás derribar con flores bomba de tu saco de bombas), y destruye la roca que hay encima con flores bomba de tu saco de bombas para encontrar una roca azul.


Luego golpea dicha roca para modificar el equilibrio temporal el edificio, y entonces los cangrancola se convertirán en esferas electrificadas que darán corriente intermitentemente y las arenas desaparecerán (quedarán al descubierto dos cofres con unas pocas rupias).

Después verás que a la derecha de la puerta cerrada del fondo hay una trampilla que se abrirá al pisar la baldosa roja que tiene delante. Mete ahí dentro a uno de los cangrancolas convertido en bola haciéndolo rodar por el suelo (cuidado con los calambrazos) o usando el telescarabajo con gancho, y así abrirás la puerta.


Cuando atravieses la puerta encontrarás otro de los generadores, el cual deberás poner en marcha de la misma manera que el anterior (clavándole la espada con una estocada, pulsando
hacia la izquierda para girarlo y presionando
hacia dentro para encajarlo).

Nota. En la estancia del generador hay un cofre con un tesoro. Para poder cogerlo tendrás que golpear la roca azul con el telescarabajo con gancho sin abandonar la habitación del generador.
| Generador de la llama roja |
Dirígete hacia el este desde la entrada al edificio del generador del rayo amarillo, y avanza hasta que el suelo termine y comiencen las arenas movedizas.

Luego utiliza balizas para marcar en el mapa la primera calzada que va hacia el sur (sudoeste en realidad) y luego la primera calzada que va hacia el sudeste. Así podrás avanzar por encima de las arenas y llegar a la zona sudeste del desierto sin hundirte en ellas (al nordeste podrás encontrar la 10.ª pieza de corazón del juego).


Una vez en la zona sudeste del desierto dirígete a un edificio que hay por allí, y en su cara sur encontrarás la puerta que te lleva a su interior, la estatua de pelícaro "Entrada al almacén" y una compuerta a mano izquierda (oeste) que puedes abrir agarrándote a un tirador que hay a su lado para formar un atajo.

Dentro del edificio deberás avanzar evitando hundirte en las arenas y llegar hasta la última plataforma con rocas que puedes alcanzar de momento. Destruye la roca con una flor bomba de tu saco de bombas y así encontrarás una roca azul, pero no la golpees por ahora.
Luego derrota a uno de los enemigos que hay por allí (cangrancola) y sube en su caparazón para cruzar las arenas y alcanzar el fondo de la sala, lugar donde encontrarás una puerta cerrada y el mecanismo para abrirla a su derecha (similar al del rayo amarillo).


Una vez al norte de la sala tendrás que subir a una zona elevada que hay a la izquierda y avanzar hacia la entrada hasta encontrar un cofre con un tesoro y un bloque metálico que debes tirar hacia abajo para hacer un atajo hacia donde estaba la roca azul. Golpéala para modificar el equilibrio temporal el edificio, y entonces los cangrancolas se convertirán en esferas electrificadas que darán corriente intermitentemente y las arenas desaparecerán (quedarán al descubierto dos cofres con unas pocas rupias).


Una vez hecho eso, utiliza el telescarabajo con gancho para coger a uno de los cangrancola convertido en bola y llevarlo hasta el mecanismo que abre la puerta del fondo, y luego dirígete a dicho mecanismo por la plataforma elevada que hay a la izquierda de la estancia y mete dentro al cangrancola haciéndolo rodar para abrir la puerta tras la que encontrarás el último de los generadores.


Finalmente, pon en marcha el generador de la misma manera que los dos anteriores (clavándole la espada con una estocada, pulsando
hacia la izquierda para girarlo y presionando
hacia dentro para encajarlo). Dentro de esa sala también encontrarás unos cofres con tesoros y rupias.

Tras activar los tres generadores deberás regresar a la fuente de alimentación que hay junto a la estatua de pelícaro "Zona norte del desierto" desandando el camino que te llevó desde el segundo generador (rayo amarillo) al tercero (llama roja). Luego consulta el mapa para ver la posición de los tres generadores.

Después golpea la roca azul que hay frente de alimentación para activarla y clava la espada en ella haciendo una estocada. Mueve el primer mecanismo 90º hacia la izquierda (con
) para poner el símbolo de la gota verde al oeste (presionando
hacia dentro para encajarlo). Luego mueve hacia la derecha el segundo mecanismo y llévalo hasta el final para colocar el símbolo de la llama roja en el sudeste. Finalmente, gira el último mecanismo hacia la izquierda hasta que el símbolo del rayo amarillo se encuentre arriba del todo (norte).

Si lo haces correctamente, la fuente de alimentación entrará en funcionamiento y hará aparecer la entrada a la refinería en el medio de esa zona. Finalmente, sube por unas escaleras que ahora habrán aparecido a la izquierda de la fuente (este) y así encontrarás la entrada a la refinería de Lanayru.

